Rozvoj lyofilizace se datuje do 20. století, kdy se stala klíčovou technologií pro ochranu a uchovávání biologických a farmaceutických produktů. Na začátku vývoje byly produkty sušeny v mrazáku, kde byla voda z produktu odpařována zamrzáním a sublimací v nízkém tlaku. Tato technologie se však postupem času zdokonalovala, a tak v roce 1938 byla vyvinuta první moderní lyofilizační technologie.
V padesátých a šedesátých letech se lyofilizace stala stále více používanou technikou pro sušení biologických a farmaceutických produktů, včetně vakcín a krevních produktů. V této době se také začala používat v kosmickém průmyslu pro konzervaci potravin pro astronauty. V sedmdesátých letech se technologie lyofilizace rozšířila do dalších oblastí, jako jsou potraviny, kosmetické výrobky a elektronika.
V posledních letech technologie lyofilizace prodělala další výrazný rozvoj, kdy se díky novým materiálům a technologiím daří sušit čím dál složitější produkty. Díky těmto inovacím se lyofilizace stále více využívá v oblasti biotechnologií a farmacie, zejména při vývoji nových léčiv, vakcín a diagnostických testů.